Monographien
- H. Klinkott, Die Satrapienregister der Alexander- und Diadochenzeit, Historia ES 145, Stuttgart 2000.
- H. Klinkott, Der Satrap. Ein persischer Amtsträger und seine Handlungsspielräume (Oikumene 1), Frankfurt a.M. 2005.
- H. Klinkott (mit S. Kubisch), Kleopatra – Politikerin, Göttin, Visionärin, Stuttgart 2011.
- H. Klinkott, S. Kubisch, Fremder König – fremdes Volk. Strukturen und Elemente der ptolemäischen Herrscherideologie und Herrschaftslegitimation am Beispiel ägyptischer Königsinschriften. (in Vorbereitung)
- H. Klinkott, C. Mileta, Mithridates VI., König von Pontos. (in Vorbereitung)
Herausgegebene Bücher
- H. Klinkott, Anatolien im Lichte kultureller Wechselwirkungen. Akkulturationsphänomene in Kleinasien und seinen Nachbarregionen während des 2. und 1. Jahrtausends v. Chr., Tübingen 2001.
- H. Klinkott, S. Kubisch, R. Müller-Wollermann, Geschenke und Steuern, Zölle und Tribute. Antike Abgabenformen in Anspruch und Wirklichkeit (CHANE 29), Boston/Leiden 2007.
- L. Dészpa, H. Klinkott, N. Kramer, Gestaltung des Übergangs – Imperiales ‚change-management‘ der Flavier (Arbeitstitel), Heidelberg. (in Vorbereitung)
Aufsätze
- H. Klinkott, Diodors Reichsbeschreibung nach Alexanders Tod. Ist die Satrapienliste XVIII 5-6 ein persisches Dokument?, in: K. Brodersen, Zwischen Ost und West, Hamburg 1999, 45-93.
- H. Klinkott, Yauna - Griechen in den Perserinschriften, in: H. Klinkott, Anatolien im Lichte kultureller Wechselwirkungen. Akkulturationsphänomene in Kleinasien und seinen Nachbarregionen während des 2. und 1. Jahrtausends v. Chr., Tübingen 2001, 107-148.
- H. Klinkott, Die Funktion des Apadana am Beispiel der Gründungsurkunde von Susa, in: M. Schuol, U. Hartmann, A. Luther, Grenzüberschreitungen. Formen des Kontakts zwischen Orient und Okzident im Altertum (Oriens et Occidens 3), Stuttgart 2002, 235-257.
- H. Klinkott, Zur politischen Akkulturation unter den Achaimeniden. Der Testfall Karien, in: H. Blum, B. Faist, P. Pfälzner, A.-M. Wittke, Brückenland Anatolien? Ursachen, Extensität und Modi des Kulturaustausches zwischen Anatolien und seinen Nachbarn, Tübingen 2002, 173-204.
- H. Klinkott, S. Kubisch, Ein lykischer Polisname in der Satrapenstele Ptolemaios' I., Chiron 35, 2005, 533-558.
- H. Klinkott, Der Großkönig und seine Satrapen. Zur Verwaltung im Achaimenidenreich, in: A. Koch, Historisches Museum der Pfalz Speyer, Pracht und Prunk der Großkönige. Das persische Weltreich (Katalog zur Ausstellung in Speyer, Juli-November 2006), Stuttgart 2006, 57-67.
- H. Klinkott, Zu Strabons Bild vom Ursprung der Völker, in: C. Ulf, R. Rollinger, Frauen und Geschlechter. Bilder - Rollen - Realitäten in den Texten antiker Autoren der römischen Kaiserzeit, Wien/Köln/Weimar 2006, 305-324.
- H. Klinkott, Griechen und Fremde, in: G. Weber, Kulturgeschichte des Hellenismus. Von Alexander dem Großen bis Kleopatra, Stuttgart 2007, 224-241.
- H. Klinkott, Steuern, Zölle und Tribute im Achaimenidenreich, in: H. Klinkott, S. Kubisch, R. Müller-Wollermann, Geschenke und Steuern, Zölle und Tribute. Antike Abgabenformen in Anspruch und Wirklichkeit, Leiden 2007, 263-290.
- H. Klinkott, Resümee, in: H. Klinkott, S. Kubisch, R. Müller-Wollermann, Geschenke und Steuern, Zölle und Tribute. Antike Abgabenformen in Anspruch und Wirklichkeit, Leiden 2007, 485-502.
- H. Klinkott, Der "Oberste Anweiser der Straße des Pharao Xerxes", in: A. Luther, R. Rollinger, J. Wiesehöfer, Getrennte Wege? Kommunikation, Raum und Wahrnehmung in der Alten Welt (Oikumene 2), Frankfurt a.M. 2007, 425-453.
- H. Klinkott, Xerxes in Ägypten. Gedanken zum negativen Perserbild in der Satrapenstele, in: S. Pfeiffer, Ägypten unter fremden Herrschern zwischen persischer Satrapie und römischer Provinz (Oikumene 3), Frankfurt a.M. 2007, 34-53.
- H. Klinkott, Zum persischen Adel im Achaimenidenreich, in: U. Walter, H. Beck, P. Scholz, Die Macht der Wenigen. Aristokratische Herrschaftspraxis, Kommunikation und ‚edler‘ Lebensstil in Antike und Früher Neuzeit, Stuttgart 2008, 207-251.
- H. Klinkott, Die Karer im Achaimenidenreich, in: F. Rumscheid, Die Karer und die Anderen, Internationales Kolloquium an der Freien Universität Berlin, 13. bis 15. Oktober 2005, Bonn 2009. 149-162.
- H. Klinkott, Zum Krieg verdammt? Xerxes und die persische Reichspolitik vor der Schlacht von Salamis, Damals 6/2010, 16-23.
- H. Klinkott, Alexandria – Polis ohne Metoiken? Möglichkeiten sozialer Mobilität bei alexandrinischen Politen, in: L.-M. Günther, Migration und Bürgerrecht in der hellenistischen Welt, Wiesbaden 2012, 21-40.
- H. Klinkott, Vespasian in Alexandria, in: L. Dészpa, H. Klinkott, N. Kramer, Gestaltung des Übergang – Imperiales ‚change-management‘ der Flavier, Heidelberg. (in Vorbereitung)
- H. Klinkott, K. Zimmer, Das klassische Theater auf der Agora von Phellos, in: M. Zimmermann, Phellos. (in Vorbereitung)
Lexikon-Artikel
- H. Klinkott, Skythen, RGA 29 (2005), § 1: Geographie und Geschichte, 36-38; § 2: Skythen-Bild, 38-40.
- H. Klinkott, Lydien, in: A.-M. Wittke, Frühgeschichte der Mittelmeerkulturen. Historisch-archäologisches Handbuch (DNP, Suppl. 10). (in Vorbereitung)
- H. Klinkott, Karien, in: A.-M. Wittke, Frühgeschichte der Mittelmeerkulturen. Historisch-archäologisches Handbuch (DNP, Suppl. 10). (in Vorbereitung)
Rezensionen
- H. Klinkott: E.R.M. Dusinberre, Aspects of Empire in Achaemenid Sardis, Cambridge 2003, in: Sehepunke 4, 2004, Nr. 12.
- H. Klinkott: M. Meier, U. Walter, Deiokes, König der Meder (Oriens et Occidens 7), Stuttgart 2004, HSozKult 24.1.2005.